首先，因为两厢车一般都属于掀背式，后玻璃和后门是一体的，雨刷转轴装在后门玻璃下方金属门体上，当后门掀起时，不会影响雨刷器。
而三厢车相对两厢车后面多了一个后备箱遮挡，没有地方装雨刷。可以想象，将雨刷转轴装在后背箱盖上，当箱盖打开时，琉璃却是不动的，那么雨刷器与琉璃的相对位置就会错位，所以不适合装。
其次，这个是一个关于流体力学的问题，如下图：
汽车在行驶时由于汽车的空间排挤了相应大小的空气，汽车在移动，在排开空气后空气由于流体的粘滞性质，无法快速的填充汽车所排开的空间。
所以在车尾处形成真空，从而形成了涡流。由于涡流的影响，两厢车后风挡处比三厢车后风挡处容易形成更大的负压，也更容易卷起尘土污染后风挡玻璃，影响后视功能。而三厢车后轮转动所产生的污水几乎都被整个后备箱给遮挡了，不会造成污水卷上后玻璃窗的情况。
所以两厢车后风挡玻璃处一般都装有雨刷器，在雨天或后窗被污染时，开启雨刷器即可获得清晰的后方视野。但也不是绝对的，后掀背式三厢车也有装备后雨刷器的，只是不常见罢了。（腾讯汽车）